インタラクティブ処理方式のパッケージソフトをインストールしたパソコンを社内LANに接続することに問題はありません。
また、社内LANがインターネットに接続されている場合も基本的には可能です。
しかし、社外ネットワークに接続する場合、NACCSセンターのセキュリティ監査を受けなくてはいけないケースがあります。

詳細はEDI仕様書の以下の記載を参照願います。
2.6 ネットワーク構成パターン｜2.6.1 利用者LANの構築パターン例（代表的な例）
7.3 各種セキュリティ対策｜7.3.3 利用者が行うセキュリティ対策
7.3 各種セキュリティ対策｜7.3.4 社外ネットワークとの接続に関するセキュリティ基準